Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC153Q494R4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC153Q494R4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms