Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4EQ3MJ16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLA2G4EQ3MJ16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLA2G4EQ3MJ16 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms