Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP13-4Q3LI77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms