Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UVSSAQ2YD98 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms