Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC57Q2TAC2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC57Q2TAC2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC57Q2TAC2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms