Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SWI5Q1ZZU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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