Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GEN1Q17RS7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GEN1Q17RS7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms