Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR2Q16832 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR2Q16832 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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