Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGCBQ16585 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCBQ16585 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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