Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NTRK3Q16288 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NTRK3Q16288 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NTRK3Q16288 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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