Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PMCHL1Q16048 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PMCHL1Q16048 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms