Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA1Q15788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NCOA1Q15788 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
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NCOA1Q15788 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
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NCOA1Q15788 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
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NCOA1Q15788 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
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NCOA1Q15788 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
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NCOA1Q15788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
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NCOA1Q15788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NCOA1Q15788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
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