Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNHIT3Q15649 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNHIT3Q15649 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms