Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

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Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIP11Q15643 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP11Q15643 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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