Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A3R2Q15599 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A3R2Q15599 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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