Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC41Q15345 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC41Q15345 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC41Q15345 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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