Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCM1Q15154 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms