Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD4Q14839 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHD4Q14839 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD4Q14839 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
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