Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF3Q14653 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF3Q14653 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF3Q14653 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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