Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAT1Q14517 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FAT1Q14517 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAT1Q14517 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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