Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBI3Q14213 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBI3Q14213 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBI3Q14213 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBI3Q14213 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBI3Q14213 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBI3Q14213 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBI3Q14213 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EBI3Q14213 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms