Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE4AQ14139 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE4AQ14139 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE4AQ14139 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4AQ14139 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4AQ14139 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBE4AQ14139 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE4AQ14139 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4AQ14139 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4AQ14139 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE4AQ14139 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4AQ14139 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBE4AQ14139 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4AQ14139 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4AQ14139 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE4AQ14139 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE4AQ14139 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
UBE4AQ14139 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE4AQ14139 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms