Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H3Q13889 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H3Q13889 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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