Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTB1Q13884 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTB1Q13884 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTB1Q13884 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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