Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMB3Q13751 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMB3Q13751 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms