Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA3CQ13748 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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