Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIN1Q13671 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIN1Q13671 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIN1Q13671 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIN1Q13671 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIN1Q13671 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIN1Q13671 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIN1Q13671 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms