Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC1Q13547 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC1Q13547 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC1Q13547 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms