Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BFSP2Q13515 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BFSP2Q13515 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
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