Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOP3AQ13472 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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