Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PMS2P3Q13401 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMS2P3Q13401 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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