Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN13Q12923 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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