Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 ALG6YOR002W 1635 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 MSC2YDR205W 2175 nt3.9□□□□□ -1.78
USB1Q12208 LAP2YNL045W 2016 nt3.9□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YDR274CYDR274C 372 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 BNS1YGR230W 414 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 DCD1YHR144C 939 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 MAD2YJL030W 591 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YMR085WYMR085W 1299 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 COG5YNL051W 1212 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 CUZ1YNL155W 825 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YPL114WYPL114W 420 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 UMP1YBR173C 447 nt3.9□□□□□ -1.79
USB1Q12208 KTR7YIL085C 1554 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 RDH54YBR073W 2877 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 LYS2YBR115C 4179 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 EAF5YEL018W 840 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YLF2YHL014C 1218 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YJL220WYJL220W 453 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 LSO1YJR005C-A 282 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 TEF4YKL081W 1239 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 GSH2YOL049W 1476 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YML020WYML020W 1995 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 IXR1YKL032C 1794 nt3.89□□□□□ -1.79
USB1Q12208 PEX29YDR479C 1665 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 EAR1YMR171C 1653 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NUP2YLR335W 2163 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 snR7-SsnR7-S 179 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NAT2YGR147C 867 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 CYC1YJR048W 330 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YIM1YMR152W 1098 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YGP1YNL160W 1065 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 RCL1YOL010W 1104 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 CBP3YPL215W 1008 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YPR174CYPR174C 666 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 PDR5YOR153W 4536 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 HMG1YML075C 3165 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 PHO84YML123C 1764 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YSH1YLR277C 2340 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 ADP1YCR011C 3150 nt3.88□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NOP58YOR310C 1536 nt3.87□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NUP42YDR192C 1293 nt3.87□□□□□ -1.79
USB1Q12208 HSP31YDR533C 714 nt3.87□□□□□ -1.79
USB1Q12208 UBC6YER100W 753 nt3.87□□□□□ -1.79
USB1Q12208 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.87□□□□□ -1.79
USB1Q12208 TDA6YPR157W 1404 nt3.87□□□□□ -1.79
USB1Q12208 GAD1YMR250W 1758 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 TAF12YDR145W 1620 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YCR006CYCR006C 474 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 TFB3YDR460W 966 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YIL165CYIL165C 360 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YRA2YKL214C 612 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 KTR2YKR061W 1278 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 RPP0YLR340W 939 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 CCS1YMR038C 750 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YNL194CYNL194C 906 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 MFM1YPL060W 1242 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 UBA3YPR066W 900 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 OM14YBR230C 405 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 SRB6YBR253W 366 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YPL260WYPL260W 1656 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 GLN4YOR168W 2430 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 IMA3YIL172C 1770 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 IMA4YJL221C 1770 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NUP133YKR082W 3474 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 GRC3YLL035W 1899 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 VID22YLR373C 2706 nt3.86□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YDL012CYDL012C 324 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 BCP1YDR361C 852 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 LPP1YDR503C 825 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 SPR6YER115C 576 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 POP3YNL282W 588 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 ARC40YBR234C 1155 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 LAP3YNL239W 1365 nt3.85□□□□□ -1.79
USB1Q12208 HXT7YDR342C 1713 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 HXT6YDR343C 1713 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 MCP2YLR253W 1710 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 BOP2YLR267W 1713 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 RAM1YDL090C 1296 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NMA1YLR328W 1206 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 CIN5YOR028C 888 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 ERG4YGL012W 1422 nt3.84□□□□□ -1.79
USB1Q12208 NMD3YHR170W 1557 nt3.84□□□□□ -1.8
USB1Q12208 OPT2YPR194C 2634 nt3.84□□□□□ -1.8
USB1Q12208 HCM1YCR065W 1695 nt3.84□□□□□ -1.8
USB1Q12208 SAF1YBR280C 1914 nt3.83□□□□□ -1.8
USB1Q12208 UBI4YLL039C 1146 nt3.83□□□□□ -1.8
USB1Q12208 MMR1YLR190W 1476 nt3.83□□□□□ -1.8
USB1Q12208 OSH2YDL019C 3852 nt3.83□□□□□ -1.8
USB1Q12208 SAT4YCR008W 1812 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 ZPR1YGR211W 1461 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 PER1YCR044C 1074 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 SAE3YHR079C-A 276 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YHR214WYHR214W 612 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YJL215CYJL215C 360 nt3.82□□□□□ -1.8
USB1Q12208 YAR066WYAR066W 612 nt3.82□□□□□ -1.8
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