Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 PDR5YOR153W 4536 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RPB2YOR151C 3675 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 GCR1YPL075W 2358 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 PHM7YOL084W 2976 nt3.68□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 MPH2YDL247W 1830 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RSM10YDR041W 612 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 SKI6YGR195W 741 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 YHR112CYHR112C 1137 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 FMP46YKR049C 402 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 CSR1YLR380W 1227 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ASC1YMR116C 960 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 MGR2YPL098C 342 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 VPS69YPR087W 321 nt3.67□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 GIP1YBR045C 1920 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 MET3YJR010W 1536 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ECM32YER176W 3366 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 ELO2YCR034W 1044 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 SNF11YDR073W 510 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 COQ4YDR204W 1008 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 RPL18BYNL301C 561 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 MEC3YLR288C 1425 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 CNM67YNL225C 1746 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 DIP2YLR129W 2832 nt3.66□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 LYS2YBR115C 4179 nt3.65□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 HPC2YBR215W 1878 nt3.65□□□□□ -1.82
ATG41Q12048 SPC19YDR201W 498 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ASP1YDR321W 1146 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 LSB1YGR136W 726 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MRP4YHL004W 1185 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YLF2YHL014C 1218 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YHR095WYHR095W 495 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 EFB1YAL003W 621 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 LDB18YLL049W 540 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YMR130WYMR130W 909 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 RRP40YOL142W 723 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 PDX3YBR035C 687 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ICY2YPL250C 411 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 KRS1YDR037W 1776 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 GCR2YNL199C 1605 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 TRM11YOL124C 1302 nt3.65□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MDM34YGL219C 1380 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 DBP3YGL078C 1572 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 RPC53YDL150W 1269 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 AAD6YFL056C 639 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 REV7YIL139C 738 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 UTP23YOR004W 765 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 FRE1YLR214W 2061 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ALD3YMR169C 1521 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ALD2YMR170C 1521 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ACE2YLR131C 2313 nt3.64□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MLH2YLR035C 2088 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 JAC1YGL018C 555 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 IMP2YMR035W 534 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YMR114CYMR114C 1107 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 SSA2YLL024C 1920 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ATG18YFR021W 1503 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ULS1YOR191W 4860 nt3.63□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 RCM1YNL022C 1473 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MBP1YDL056W 2502 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 PTC1YDL006W 846 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 RFC2YJR068W 1062 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 VPS68YOL129W 555 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 CHL1YPL008W 2586 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MTC4YBR255W 2085 nt3.62□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 FZO1YBR179C 2568 nt3.61□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 SSH4YKL124W 1740 nt3.61□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MNL1YHR204W 2391 nt3.61□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 SPR6YER115C 576 nt3.61□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 IRC9YJL142C 393 nt3.61□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 RGS2YOR107W 930 nt3.61□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MCM4YPR019W 2802 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 PPZ1YML016C 2079 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 KRE9YJL174W 831 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MID2YLR332W 1131 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 AST1YBL069W 1290 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 HSP26YBR072W 645 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 SMF1YOL122C 1728 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 BIK1YCL029C 1323 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 MNN1YER001W 2289 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ERG4YGL012W 1422 nt3.6□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 PRT1YOR361C 2292 nt3.59□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 FRA2YGL220W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 HIS6YIL020C 786 nt3.59□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.59□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 SUL2YLR092W 2682 nt3.59□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 ATG23YLR431C 1362 nt3.59□□□□□ -1.83
ATG41Q12048 GAC1YOR178C 2382 nt3.59□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 YEH2YLR020C 1617 nt3.59□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 DPB2YPR175W 2070 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 GUS1YGL245W 2127 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 RAM1YDL090C 1296 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 API2YDR525W 330 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 YGR122WYGR122W 1209 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 MHO1YJR008W 1017 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 CBT1YKL208W 816 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 URE2YNL229C 1065 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 RCL1YOL010W 1104 nt3.58□□□□□ -1.84
ATG41Q12048 YPL278CYPL278C 303 nt3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms