Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFFO1Q0D2I5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFFO1Q0D2I5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms