Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM27E3Q08E93 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FAM27E3Q08E93 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM27E3Q08E93 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms