Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4DQ08499 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms