Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHX9Q08211 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms