Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP4Q07065 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP4Q07065 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms