Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNDQ07001 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNDQ07001 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNDQ07001 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms