Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GABPAQ06546 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABPAQ06546 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms