Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDSRQ06136 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms