Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CALD1Q05682 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALD1Q05682 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms