Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 PRM7YDL039C 2097 nt3.49□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 YIL171WYIL171W 330 nt3.49□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 GRC3YLL035W 1899 nt3.49□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 ORC6YHR118C 1308 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 THI13YDL244W 1023 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 NUP42YDR192C 1293 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 THI11YJR156C 1023 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 PEP4YPL154C 1218 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 STE12YHR084W 2067 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 FLO8YER109C 2400 nt3.48□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 PEP5YMR231W 3090 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 SSH4YKL124W 1740 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 COQ4YDR204W 1008 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 SOL4YGR248W 768 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 YNK1YKL067W 462 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 SEC72YLR292C 582 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 SPS19YNL202W 879 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 SPS18YNL204C 903 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 YHR177WYHR177W 1362 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 MET12YPL023C 1974 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 DPH6YLR143W 2058 nt3.47□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 YPL260WYPL260W 1656 nt3.46□□□□□ -1.85
YHP1Q04116 CYM1YDR430C 2970 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PTA1YAL043C 2358 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 GSM1YJL103C 1857 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 TRM8YDL201W 861 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 ISA1YLL027W 753 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YML119WYML119W 1074 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 ICY2YPL250C 411 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 ECM2YBR065C 1095 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 VPS73YGL104C 1461 nt3.46□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 TGL4YKR089C 2733 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 EGT2YNL327W 3126 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 ARC1YGL105W 1131 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YHR140WYHR140W 720 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 NVJ1YHR195W 966 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 ACP1YKL192C 378 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 SKG6YHR149C 2205 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 CEG1YGL130W 1380 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 MST1YKL194C 1389 nt3.45□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 MET3YJR010W 1536 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YOL153CYOL153C 1746 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 FPK1YNR047W 2682 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PRP28YDR243C 1767 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 MDM34YGL219C 1380 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RAD27YKL113C 1149 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 NMD4YLR363C 657 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YLR407WYLR407W 687 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YDC1YPL087W 954 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 TIF4632YGL049C 2745 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 HIS4YCL030C 2400 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 BUD8YLR353W 1812 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 LAS1YKR063C 1509 nt3.44□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PHO84YML123C 1764 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 NNK1YKL171W 2787 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PDR5YOR153W 4536 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 UPS3YDR185C 540 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RPL24AYGL031C 468 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PRE9YGR135W 777 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RFC2YJR068W 1062 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YLR125WYLR125W 411 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 IMP2YMR035W 534 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YNL057WYNL057W 333 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 SUI1YNL244C 327 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YPL278CYPL278C 303 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 HAL1YPR005C 885 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 TIF5YPR041W 1218 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 SRB6YBR253W 366 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RIM21YNL294C 1602 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 SBE2YDR351W 2595 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 LCB2YDR062W 1686 nt3.43□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PTR2YKR093W 1806 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 SNF2YOR290C 5112 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 IZH3YLR023C 1632 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YAR023CYAR023C 540 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 NKP2YLR315W 462 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 RRN9YMR270C 1098 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 MVD1YNR043W 1191 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 PDX3YBR035C 687 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YBR139WYBR139W 1527 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 SEN1YLR430W 6696 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 UBP7YIL156W 3216 nt3.42□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 STB2YMR053C 2553 nt3.41□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 TDA11YHR159W 1515 nt3.41□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 HMLALPHA1YCL066W 528 nt3.41□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 MATALPHA1YCR040W 528 nt3.41□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 ROT1YMR200W 771 nt3.41□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 YNG1YOR064C 660 nt3.41□□□□□ -1.86
YHP1Q04116 CBP3YPL215W 1008 nt3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.5 ms