Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NHLH1Q02575 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms