Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC3AQ02505 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms