Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAP1Q01518 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAP1Q01518 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAP1Q01518 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAP1Q01518 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAP1Q01518 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAP1Q01518 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms