Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A2Q01362 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A2Q01362 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A2Q01362 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A2Q01362 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A2Q01362 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A2Q01362 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A2Q01362 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms