Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCCQ00597 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCCQ00597 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FANCCQ00597 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms