Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF1P84077 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF1P84077 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARF1P84077 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARF1P84077 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARF1P84077 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ARF1P84077 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARF1P84077 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARF1P84077 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARF1P84077 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARF1P84077 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARF1P84077 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARF1P84077 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARF1P84077 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARF1P84077 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARF1P84077 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms